O centro vai funcionar na prevenção de doenças que tem animais como vetores de transmissão para seres humanos. Segundo o prefeito, há possibilidade de que aquela unidade estabeleça convênio com a Universidade Estadual de Santa Cruz (Uesc), no sentido de disponibilizar espaços e ações para que estudantes do curso de medicina veterinária possam utilizar as instalações físicas para a realização de estágios viabilizando projetos específicos nas áreas científica e acadêmica.
Construído numa área de 829 metros quadrados, o Centro de Zoonoses de Ilhéus conta com um núcleo administrativo, guarita, garagem, canil, sala para vacinas, curral, triturador de alimentos, pocilga, baias para animais, estação de tratamento de esgoto, com áreas urbanizadas e de estacionamento e quadra gramada. Consta no projeto da unidade a realização de campanhas educativas periódicas para que a população seja agente multiplicador de informações no que diz respeito à melhoria das condições sanitárias.